Eine der wichtigsten kulturellen Sehenswürdigkeiten in der Nähe von Pejë und im ganzen Land ist das Patriarchenkloster, das sich direkt am Eingang zur Rugova-Schlucht am Fluss Bistrica befindet.

Die Ursprünge des beeindruckenden mittelalterlichen Klosterkomplexes inmitten der sehr gepflegten Gärten reichen bis ins frühe 13. Jahrhundert zurück. Der Patriarchalsitz war das geistliche Zentrum der serbischen Erzbischöfe und auch die Grabstätte vieler von ihnen. Mit seinen Kunstschätzen und Schreinen gilt das Konvent als Schatzkammer der serbischen Geschichte und als einer der heiligsten Orte der serbisch-orthodoxen Kirche. Im Jahr 2006 schaffte es das einzigartige Bauwerk auf die UNESCO-Welterbeliste, und 1947 wurde es zu einem außergewöhnlich wichtigen Kulturdenkmal erklärt. Gleichzeitig steht es jedoch aufgrund der immer noch schwierigen Sicherheitslage auf der Roten Liste der geschützten Denkmäler. Heute wird das Anwesen von orthodoxen Nonnen unter dem Schutz der KFOR geführt.

Da das Kloster Žiča am Fluss Ibar (bei Kraljevo/Serbien), der erste Sitz des serbisch-orthodoxen Erzbistums, von der ungarischen Armee stark bedroht war, beauftragte der Heilige Sava von Serbien seinen Nachfolger Arsenije mit der Wahl eines neuen Standortes für das Erzbistum. Im ersten Drittel des 13. Jahrhunderts wurde an diesem exponierten Ort am Ausgang der Rugova-Schlucht auf den Ruinen einer kleinen Kirche aus dem 11. Jahrhundert die Kirche der Heiligen Apostel errichtet. Der Stil war sehr einfach, mit einem einzigen Kirchenschiff, einer Kuppel und einer halbkreisförmigen Apsis. Die ersten Fresken wurden zwischen 1250 und 1260 gemalt, und die temporäre serbisch-orthodoxe Kirche befand sich hier von 1253 bis 1285, bevor sie 1291 dauerhaft vom Kloster Žiča hierher verlegt wurde.

Die kleine Seitenkapelle der Apostelkirche wurde zwischen 1321 und 1324 durch die Demetriuskirche im byzantinischen Stil mit kreuzförmigem Grundriss ersetzt, und zwischen 1330 und 1337 wurden die Kirche der Gottesmutter Hodegetria (Marienkirche) und die Kapelle des Heiligen Nikolaus im Süden errichtet. Im Jahr 1346 verlieh Stefan Uroš IV. Dušan Pejë den Rang eines Patriarchats. Und selbst nachdem die Osmanen die Kontrolle über das serbische Reich übernommen hatten, blieb Pejë der Sitz der serbisch-orthodoxen Kirche bis zum Tod von Arsenije II. im Jahr 1463, als das Patriarchat von Sultan Mehmed II. abgeschafft wurde, aber umfangreiche Restaurierungen und Erweiterungen erfuhr und auch neue Fresken geschaffen wurden.

Im 16. Jahrhundert wurde der Komplex zu einer geschlossenen Einheit umgebaut und vereinte fortan vier Kirchen mit einem gemeinsamen, offenen Narthex für die drei großen. Ende des 17. Jahrhunderts stellte der Österreichisch-Türkische Krieg eine Bedrohung für das Patriarchat dar. Die wertvollsten Kirchenschätze wurden nach Graçanica gebracht, dort aber von den Türken entdeckt und geplündert. Dasselbe geschah mit den in Pejë verbliebenen Schätzen, als Arsenije III. 1689 nach Österreich floh. Ein Großteil der Wertsachen wurde später zurückgekauft.

Im 18. Jahrhundert geriet Pejë unter Druck des Ökumenischen Patriarchats von Konstantinopel und kam schließlich unter griechische Herrschaft. 1831 wurde das Patriarchat erneut geplündert, diesmal von Pascha Arslan von Bosnien. Mitte des 19. Jahrhunderts wurde ein Gästehaus gebaut, die Wassermühle restauriert und die Fresken erweitert. Nach dem Ende des Ersten Weltkriegs erhielt das Patriarchat seine volle Funktion zurück, wurde aber nach dem Zweiten Weltkrieg in ein Kloster umgewandelt. Umfangreiche archäologische Arbeiten wurden durchgeführt und Tempelmauern sowie ein Friedhof aus der frühchristlichen Zeit freigelegt. Die imposanten Stelen tragen Inschriften in Latein.

1981 wurde das alte Schlafgebäude von albanischen Extremisten in Brand gesteckt, und während des Krieges wurde das Kloster wiederholt brutalen Angriffen ausgesetzt. Heute ist das ehemalige Patriarchat immer noch ein wichtiges serbisch-orthodoxes Zentrum in der Region, in dem 26 Nonnen und ein Abt unter dem Schutz italienischer KFOR-Soldaten leben.

Trotz der verschiedenen Epochen präsentiert sich der Klosterkomplex als harmonische Einheit und gilt als einzigartig in der serbischen Kirchenarchitektur. Die gut erhaltenen Fresken veranschaulichen lebhaft die Entwicklung der serbischen Kirchenmalerei über vier Jahrhunderte. Der byzantinische Stil dominiert in der Apostelkirche mit allgemeinen Darstellungen wie der Himmelfahrt in der Kuppel, dem Letzten Abendmahl und der Auferweckung des Lazarus. Die Darstellungen in der Demetriuskirche beschreiben das Leben der Heiligen und Kirchenfeste. Die Fresken in der Marienkirche sind Jesus und den Propheten sowie dem Stammbaum der Nemanjiden gewidmet. Die umfangreiche Klosterschatzkammer umfasst Ikonen aus dem 14. bis 19. Jahrhundert und Manuskripte in Altslawisch. Das Patriarchat ist auch das größte Mausoleum serbischer Würdenträger. Erzbischöfe wurden hier vom 13. bis 15. Jahrhundert und im 17. Jahrhundert begraben, und das Kloster enthält Reliquien wichtiger serbischer Kirchenführer. Im Jahr 2006 wurde das Kloster restauriert und zwei bisher unbekannte Fresken an der Außenfassade der Demetriuskirche entdeckt. Im März 2009 ließ Bischof Artemije in einer Nacht-und-Nebel-Aktion die Wände von seiner eigenen Baufirma tiefrot streichen, wobei wertvolle Ornamente übermalt wurden. Das serbische Kulturministerium verurteilte die Aktion und kritisierte den Bischof scharf, doch die Tat ist bis heute ohne Folgen geblieben.

Ein prächtiger über 750 Jahre alter Maulbeerbaum, der seinerzeit von Erzbischof Sava II. gepflanzt wurde, gedeiht im Innenhof.

(täglich von 9.30-17 Uhr, Ausweiskontrolle am Kontrollpunkt).