Ce musée a ouvert ses portes en 2016 sur l'ancien site du musée des locomotives à vapeur d'Umekoji, près de la gare de Kyoto. Il expose plus de 50 trains historiques, des locomotives à vapeur aux emblématiques Shinkansen des séries 0 et 500, dont beaucoup sont accessibles de près et certains même visibles par le dessous.

Le musée comprend un immense diorama ferroviaire à l'échelle 1/80, des simulateurs de conduite de train, des signaux et des voies miniatures fonctionnels, ainsi qu'un tour en locomotive à vapeur sur une voie de 1 km (moyennant un petit supplément). La rotonde adjacente de 1914 abrite la plus grande collection de locomotives à vapeur du Japon, avec la possibilité d'observer la maintenance en direct à travers des fenêtres. De plus, les anciens bâtiments de la gare de Nijo marquent la sortie, et une terrasse d'observation et un café à l'étage surplombent les trains JR et Shinkansen qui passent.