Een van de belangrijkste culturele bezienswaardigheden in de buurt van Pejë en in het hele land is het Patriarchale Klooster, dat direct aan de ingang van de Rugova-kloof aan de rivier de Bistrica ligt.

De oorsprong van het indrukwekkende middeleeuwse kloostercomplex, midden in de zeer goed onderhouden tuinen, gaat terug tot het begin van de 13e eeuw. De patriarchale zetel was het spirituele centrum van de Servische aartsbisschoppen en ook de begraafplaats van velen van hen. Met zijn kunstschatten en heiligdommen wordt het klooster beschouwd als een schatkamer van de Servische geschiedenis en een van de heiligste plaatsen van de Servisch-Orthodoxe Kerk. In 2006 werd het unieke gebouw opgenomen op de UNESCO Werelderfgoedlijst, en in 1947 werd het uitgeroepen tot een uitzonderlijk belangrijk cultureel monument. Tegelijkertijd staat het echter op de Rode Lijst van beschermde monumenten vanwege de nog steeds moeilijke veiligheidssituatie. Tegenwoordig wordt het landgoed beheerd door orthodoxe nonnen onder bescherming van KFOR.

Omdat het Žiča-klooster aan de rivier de Ibar (nabij Kraljevo/Servië), de eerste zetel van het Servisch-Orthodoxe aartsbisdom, ernstig werd bedreigd door het Hongaarse leger, vertrouwde de heilige Sava van Servië zijn opvolger Arsenije de taak toe om een nieuwe locatie voor het aartsbisdom te kiezen. In het eerste derde deel van de 13e eeuw werd de Kerk van de Heilige Apostelen gebouwd op de ruïnes van een kleine kerk uit de 11e eeuw op deze prominente locatie aan de uitgang van de Rugova-kloof. De stijl was zeer eenvoudig, met een enkel schip, een koepel en een halfronde apsis. De eerste fresco's werden tussen 1250 en 1260 geschilderd, en de tijdelijke Servisch-Orthodoxe kerk bevond zich hier van 1253 tot 1285 voordat deze in 1291 permanent vanuit het Žiča-klooster hierheen werd verplaatst.

De kleine zijkapel van de Kerk van de Apostelen werd tussen 1321 en 1324 vervangen door de Byzantijnse Demetriuskerk met een kruisvormige plattegrond, en tussen 1330 en 1337 werden de kerk van de Moeder Gods Hodegetria (Sint-Mariakerk) en de Kapel van Sint-Nicolaas in het zuiden gebouwd. In 1346 verleende Stefan Uroš IV. Dušan Pejë de rang van patriarchaat. En zelfs nadat de Ottomanen de controle over het Servische Rijk overnamen, bleef Pejë de zetel van de Servisch-Orthodoxe Kerk tot de dood van Arsenije II in 1463, toen het patriarchaat werd afgeschaft door Sultan Mehmed II, maar het onderging uitgebreide restauratie en uitbreiding, en er werden ook nieuwe fresco's gemaakt.

In de 16e eeuw werd het complex verbouwd tot een gesloten eenheid en verenigde het vanaf dat moment vier kerken met een gemeenschappelijke, open narthex voor de drie grote. Aan het einde van de 17e eeuw vormde de Oostenrijks-Turkse Oorlog een bedreiging voor het patriarchaat. De meest waardevolle kerkschatten werden naar Graçanica gebracht, maar werden daar door de Turken ontdekt en geplunderd. Hetzelfde gebeurde met de schatten die in Pejë achterbleven toen Arsenije III in 1689 naar Oostenrijk vluchtte. Een groot deel van de waardevolle spullen werd later teruggekocht.

In de 18e eeuw kwam Pejë onder druk te staan van het Oecumenisch Patriarchaat van Constantinopel en kwam uiteindelijk onder Grieks bestuur. In 1831 werd het patriarchaat opnieuw geplunderd, dit keer door Pasja Arslan van Bosnië. Halverwege de 19e eeuw werd een gastenverblijf gebouwd, de watermolen gerestaureerd en de fresco's uitgebreid. Na het einde van de Eerste Wereldoorlog kreeg het patriarchaat zijn volledige functie terug, maar werd na de Tweede Wereldoorlog omgevormd tot een klooster. Uitgebreide archeologische werkzaamheden werden uitgevoerd en tempelmuren en een begraafplaats uit de vroegchristelijke tijd werden blootgelegd. De imposante stèles dragen inscripties in het Latijn.

In 1981 werd de oude slaapzaal in brand gestoken door Albanese extremisten en tijdens de oorlog werd het klooster herhaaldelijk onderworpen aan brutale aanvallen. Tegenwoordig is het voormalige patriarchaat nog steeds een belangrijk Servisch-Orthodox centrum in de regio, met 26 nonnen en een abt die daar leven onder de bescherming van Italiaanse KFOR-soldaten.

Ondanks de verschillende tijdperken presenteert het kloostercomplex zich als een harmonieuze eenheid en wordt het beschouwd als uniek in de Servische kerkarchitectuur. De goed bewaarde fresco's illustreren levendig de ontwikkeling van de Servische kerkelijke schilderkunst gedurende vier eeuwen. De Byzantijnse stijl domineert in de Kerk van de Apostelen, met algemene voorstellingen zoals de Hemelvaart in de koepel, het Laatste Avondmaal en de Opwekking van Lazarus. De voorstellingen in de Kerk van Sint Demetrius beschrijven de levens van de heiligen en kerkelijke feesten. De fresco's in de Sint-Mariakerk zijn gewijd aan Jezus en de profeten, evenals de stamboom van de Nemanjiden. De uitgebreide kloosterschatkamer omvat iconen uit de 14e tot 19e eeuw en manuscripten in Oud-Slavisch. Het patriarchaat is ook het grootste mausoleum van Servische hoogwaardigheidsbekleders. Aartsbisschoppen werden hier begraven van de 13e tot de 15e eeuw en in de 17e eeuw, en het klooster bevat relikwieën van belangrijke Servische kerkleiders. In 2006 werd het klooster gerestaureerd en werden twee voorheen onbekende fresco's ontdekt op de buitenfaçade van de Sint-Demetriuskerk. In maart 2009 liet bisschop Artemije zijn eigen bouwbedrijf de muren dieprood schilderen in een heimelijke operatie, waarbij waardevolle ornamenten werden overgeschilderd. Het Servische Ministerie van Cultuur veroordeelde de actie en bekritiseerde de bisschop scherp, maar de daad is tot op heden zonder gevolgen gebleven.

Een prachtige, meer dan 750 jaar oude moerbeiboom, destijds geplant door aartsbisschop Sava II, gedijt op de binnenplaats.

(dagelijks van 9.30-17 uur, ID-controle bij de controlepost).