Die erste Hauptstadt der Insel São Miguel.
Vila Franca do Campo zeigt sein Gemeindemotto „Quis sicut deus?“ auf seiner Flagge und seinem Wappen. Dieser lateinische Satz bedeutet „Wer ist wie Gott?“. Es ist eine Anspielung auf den Erzengel Michael, nach dem die Insel São Miguel benannt ist; im Hebräischen bedeutet der Name Michael „der, der wie Gott ist“.
Die Mitte des 15. Jahrhunderts von Gonçalo Vaz Botelho gegründete Siedlung wurde 1472 in den Status einer Vila (Stadt) erhoben; Vila Franca do Campo entwickelte sich schnell zur größten Siedlung und zum Verwaltungssitz der Insel São Miguel.
Die größte Tragödie, die die Azoren heimsuchte, ereignete sich am 20. Oktober 1522, als ein heftiges Erdbeben das Gebiet von Vila Franca do Campo traf, damals Hauptstadt des Archipels und wichtigste azorische Siedlung. Während des Erdbebens und des anschließenden Erdrutsches kamen 5000 Menschen ums Leben, wobei der damalige Captain-Donatário Rui Gonçalves da Câmara II der Tragödie entging: Er entspannte sich zum Zeitpunkt der Tragödie in seinem Sommerhaus in Lagoa. Viele der Bewohner wurden durch einen Erdrutsch und Trümmer lebendig begraben. Aufgrund dieser Zerstörung wurde die Hauptstadt von São Miguel nach Ponta Delgada verlegt, wo der Captain-Donatário seine Verwaltung in einer Residenz in der Nähe der Kirche von São Pedro einrichtete. König Johann III. erhob Ponta Delgada schließlich am 2. April 1546 in den Status einer Stadt, was immer mehr wirtschaftliche Aktivitäten und Siedlungen anzog.
Im Anschluss an die Seeschlacht von 1582 vor der Küste von São Miguel ließen die spanischen Sieger mehrere hundert französische und portugiesische Gefangene in der Stadt hinrichten.
Die Stadt begann ab dem 18. Jahrhundert wieder zu florieren, zunächst durch Orangenplantagen und später durch die Ananasproduktion.